1986年南充師范學院地理系創(chuàng)建。1996年12月四川省教委、四川省國土局批準成立了國土管理學院；2003年9月更名為國土資源學院。隨著時代需求的變化、學院事業(yè)的發(fā)展及服務地方的需要，學院回歸初心、回歸本源、回歸學科，2021年6月更名為地理科學學院。全院現(xiàn)有教職工70余人，其中教授近20人，副教授近30人，享受政府特殊津貼專家1人，專任教師中具有博士學位的教師占教師總數(shù)的60%以上；聘有中國科學院院士、國家“萬人計劃”領軍人才等專家10余名。三十余載，從地理系到地理科學學院薪火相傳，已經成為特色鮮明、具有一定區(qū)域影響力的人才培養(yǎng)基地。

學院現(xiàn)有地理科學、人文地理與城鄉(xiāng)規(guī)劃、地理信息科學、測繪工程4個本科專業(yè)，招收地理學一級學科、水土保持與荒漠化防治二級學科的學術型碩士研究生，招生學科教學（地理）專業(yè)型碩士研究生。

2000年學院被批準為四川省地理科學本科人才培養(yǎng)基地。2008年地理科學專業(yè)被批準為四川省特色專業(yè)，2010年被批準為國家級特色專業(yè)，2019年被批準為省級一流本科專業(yè)。2017年地理信息科學專業(yè)被批準為四川省首批普通本科高校應用型示范專業(yè)。《環(huán)境保護》《水文學》《人文地理學》先后獲批四川省精品課程和重點課程，《遙感導論》《數(shù)字高程模型原理及應用》獲批四川省首批地方普通本科高校應用型示范課程。2021年《人文地理學》獲批省級一流課程。

2009年丘陵地區(qū)國土資源統(tǒng)籌利用工程實驗室獲批四川省高校重點實驗室，資源與環(huán)境信息系統(tǒng)實驗教學示范中心獲批省級實驗教學示范中心；2015年資源與環(huán)境虛擬仿真實驗教學中心獲批省級虛擬仿真實驗教學中心。2019年四川省干旱河谷土壤侵蝕監(jiān)測與控制工程實驗室獲批立項建設，并與喜德縣人民政府共同建設大小涼山干旱河谷土壤侵蝕與生態(tài)修復野外科學觀測研究站。

學院堅持以面向世界科技前沿、面向經濟主戰(zhàn)場，面向國家重大需求、面向人民生命健康為導向，以青藏高原東緣干旱河谷區(qū)、嘉陵江流域為重點研究區(qū)域，服務于長江上游生態(tài)安全屏障、成渝雙城經濟圈建設，組建了土地退化、地理信息、流域環(huán)境、鄉(xiāng)村地理四個方向的科研團隊。2017年“干熱河谷溝谷侵蝕與控制”獲批四川省高?？蒲袆?chuàng)新團隊。先后承擔國家自然科學基金、國家社科基金、教育部、四川省科技廳等各類縱向科研項目，承擔地方政府委托的國土空間規(guī)劃、國土整治規(guī)劃設計、國土資源調查與測繪、旅游資源調查、旅游規(guī)劃、行業(yè)和部門的“十四五”發(fā)展規(guī)劃、生態(tài)環(huán)境保護等領域科技服務項目多項；在Chinese Science Bulletin,Science China-Earth Sciences,International Soil and Water Conservation Research,Catena,Agriculture Ecosystems & Environment,Geomorphology,Environmental Pollution,ISPRS International Journal of Geo-Information,Sustainability,《中國軟科學》《地理學報》《地理研究》《地理科學》《經濟地理》《人文地理》《生態(tài)學報》《自然資源學報》《自然災害學報》《地震學報》《水土保持學報》《土壤學報》等國內外主流刊物上發(fā)表研究論文逾60篇；出版著作10余部，研究成果獲得省部級科技進步獎、國土資源部優(yōu)秀成果獎、省級優(yōu)秀教學成果獎等榮譽。